El chitosán se emplea principalmente como una ayuda en el crecimiento de las plantas, debido a sus propiedades como sustancia que permite promover la defensa contra infecciones provocadas por hongos. Su uso ha sido aprobado por muchos cultivadores de plantas de interior y exterior. El principio activo se ha encontrado en los caparazones de los crustáceos, tales como langostas, cangrejos y gambas, así como en otros organismos con exoesqueleto. El chitosán ha sido utilizado para la coagulación de caseínas de leche y producción de quesos de bajo contenido calórico.
El chitosán se emplea en la filtración y depurado de aguas, allí donde es necesario remover partículas en suspensión de un líquido.
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